Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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