Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdhd3Q9CYW4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms