Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Xrcc3Q9CXE6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xrcc3Q9CXE6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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