Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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