Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdm1Q9CQK3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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