Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znhit3Q9CQK1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znhit3Q9CQK1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms