Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DenrQ9CQJ6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DenrQ9CQJ6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DenrQ9CQJ6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DenrQ9CQJ6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DenrQ9CQJ6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DenrQ9CQJ6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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