Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms