Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms