Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl17Q9CPR4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl17Q9CPR4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms