Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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