Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms