Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TirapQ99JY1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TirapQ99JY1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TirapQ99JY1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TirapQ99JY1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms