Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn16Q925N4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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