Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PdgfdQ925I7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms