Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf144aQ925F3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf144aQ925F3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf144aQ925F3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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