Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek8Q91ZR4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek8Q91ZR4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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