Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Creb3l3Q91XE9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Creb3l3Q91XE9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms