Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Krt79Q8VED5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Krt79Q8VED5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt79Q8VED5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Krt79Q8VED5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Krt79Q8VED5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Krt79Q8VED5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Krt79Q8VED5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Krt79Q8VED5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Krt79Q8VED5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Krt79Q8VED5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt79Q8VED5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms