Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms