Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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