Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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