Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Hpf1Q8CFE2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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