Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc17Q8CE13 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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