Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms