Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms