Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms