Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4bQ8BGE6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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