Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms