Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ttc28Q80XJ3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ttc28Q80XJ3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ttc28Q80XJ3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ttc28Q80XJ3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc28Q80XJ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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