Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms