Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Avl9Q80U56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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