Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
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