Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf139Q7TMV1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms