Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1cQ76I25 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms