Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms