Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnt1Q6ZPR4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Kcnt1Q6ZPR4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms