Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RgmaQ6PCX7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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