Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms