Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca2Q6DIC0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca2Q6DIC0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms