Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms