Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ecm1Q61508 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ecm1Q61508 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms