Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms