Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd1Q61345 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Foxd1Q61345 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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