Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cnot7Q60809 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Cnot7Q60809 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot7Q60809 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms