Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms