Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms