Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med13Q5SWW4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med13Q5SWW4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms