Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynrgQ5SV85 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SynrgQ5SV85 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms