Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bbs12Q5SUD9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms